L'atelier de bricolage (des solvants, des décapants, des colles (COV), des fumées, des poussières, des sciures de bois, etc.
des poussières, des acariens, etc. Les bois, revêtements de sols et autres matériaux imprégnés: des lasures, des solvants, des peintures, du formaldéhyde, etc.
Certaines plantes: des allergènes Le garage: divers peintures, résines modifier Air du lieu de travail Article détaillé:
Valeur limite pour la protection de la végétation (en zone éloignée d'habitation, d'industrie ou d'autoroute:
Valeur limite pour la protection de la végétation (AOT 40), calculée à partir de valeurs moyennes horaires mesurées de mai à juillet:
L'approche normative générale vise divers objectifs de différentes natures objectif de qualité valeur limite en matière de protection de la santé humaine, de protection de la végétation et de protection des écosystèmes:
voir l'article: Valeur d'exposition. seuil d'alerte Les périodes de temps considérées varient
Nichée dans le cratère d'un ancien volcan à 2240 m, Mexico était, en 1992,
aussi contenir du dioxyde de soufre, des oxydes d'azote, de fines substances en suspension sous forme d'aérosol, des poussières et des micro-organismes
#a b c d e f g h i j k l, m et n Air sur olivier. fournet. free fr. Consulté le 4 mars 2010#a b c, d et e (en) Compressed Gas Association, Handbook of compressed gases, Springer, 1999,4 e éd.,702 p. ISBN
(page consultée le 4 mars 2010)# L'air fortement asséché contient en pratique encore des traces de vapeur d'eau.#Indice de réfraction de l'Air sur olivier. fournet. free fr.
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et protéger la nature et la santé des citoyens des États-unis 1 Sa mission est de protéger la santé humaine
et de sauvegarder les éléments naturels#l'air, l'eau et la terre#essentiels à la vie
Nature 1964 Wilderness Act of 1964 Nature PL 88-577 1968 Scenic Rivers Preservation Act
Nature PL 90-542 1969 National Environmental Policy Act Nature PL 91-190 1970 Wilderness Act of 1970
Nature PL 91-504 1977 Surface Mining Control and Reclamation Act Nature PL 95-87
1978 Wilderness Act of 1978 Nature PL 98-625 1980 Alaska Land Protection Act Nature
PL 96-487 1994 California Desert Protection Act Nature PL 103-433 1946 Coordination Act
Espèces en voie d'extinction PL 79-732 1966 Endangered Species Preservation Act Espèces en voie d'extinction PL 89-669
1969 Endangered Species Conservation Act Espèces en voie d'extinction PL 91-135 1972 Marine Mammal Protection Act
Espèces en voie d'extinction PL 92-522 1973 Endangered Species Act of 1973 Espèces en voie d'extinction
PL 93-205 1965 Solid Waste Disposal Act Divers PL 89-272 1969 National Environmental Policy Act
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Bacteria-Wikipédia Bacteria Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre Aller à: Navigation, rechercher Bactérie
Une bactérie Deinococcus radiodurans Classification Domaine Prokaryota Règne Bacteria#auteur incomplet#,date à préciser Divisions de rang inférieur
Selon le Taxonomy Browser du NCBI 1: Acidobacteria Actinobacteria Aquificae Bacterioidetes Chlamydiae Chlorobi Chloroflexi Chrysiogenetes Cyanobacteria Deferribacteres Deinococcus-Thermus Dictyoglomi Fibrobacteres Firmicutes Fusobacteria Gemmatimonadetes Nitrospira Planctomycetes Proteobacteria
Spirochaetes Thermodesulfobacteria Thermomicrobia Thermotogae Verrucomicrobia Bacteria Incertae sedis Classification phylogénétique Position: Bacteria Unibacteria Posibacteria Firmicutes Actinobacteria Thermotogae Negibacteria Eobacteria Deinococcus-Thermus Chloroflexi Glycobacteria Aquificae Bacterioidetes Chlamydiae Cyanobacteria Nitrospira Planctomycetes Proteobacteria Spirochaetes
Retrouvez ce taxon sur Wikispecies D'autres documents multimédia sont disponibles sur Commons Une bactérie,
ou bacteria, est un organisme vivant unicellulaire procaryote (caractérisé par une absence de noyau et d'organite
La plupart des bactéries possèdent une paroi cellulaire glucidique, le peptidoglycane. Les bactéries les plus grosses mesurent plus de 2 m
et on considérait jusqu'à il y a peu que les plus petites mesuraient 0, 2 m, mais on a il y a peu découvert des ultramicrobactéries, y compris en eau douce 2, 3,
4. Elles présentent de nombreuses formes: sphériques (coques), allongées ou en bâtonnets (bacilles), des formes plus ou moins spiralées.
L'étude des bactéries est la bactériologie, une branche de la microbiologie Coques à gauche, Spirillum au centre, bacille à droite
Les bactéries sont ubiquitaires et sont présentes dans tous les types de biotopes rencontrés sur Terre.
Elles peuvent être isolées du sol, des eaux douces, marines ou saumâtres, de l'air, des profondeurs océaniques, des déchets radioactifs 5, de la croûte terrestre, sur la peau et dans l'intestin des animaux.
Il y a environ 40 millions de cellules bactériennes dans un gramme de sol et 1 million de cellules bactériennes dans un millilitre d'eau douce.
On estime qu'il y aurait donné (à un instant) quatre à six quintillions (4 ×10 30 à 6×10 30
soit entre 4 et 6 mille milliards de milliards de milliards de bactéries dans le monde 6, représentant une grande partie de la biomasse du monde 6. Cependant,
un grand nombre de ces bactéries ne sont caractérisées pas encore car non cultivables en laboratoire 7. Les bactéries ont une importance considérable dans les cycles biogéochimiques comme le cycle du carbone et la fixation de l'azote de l'atmosphère
Chez l'Homme, il a été calculé que 10 12 bactéries colonisent la peau, 10 10 bactéries colonisent la bouche
et 10 14 bactéries habitent dans l'intestin, ce qui fait qu'il y a dix fois plus de cellules bactériennes
que de cellules humaines dans le corps humain 8. La plupart de ces bactéries sont inoffensives ou bénéfiques pour l'organisme.
Il existe cependant de nombreuses espèces pathogènes à l'origine de beaucoup de maladies infectieuses comme le choléra, la syphilis, la peste, l'anthrax, la tuberculose.
Le plus souvent, les maladies bactériennes mortelles sont les infections respiratoires: la tuberculose à elle seule tue environ 2 millions de personnes par an,
principalement en Afrique subsaharienne 9. Des bactéries peuvent entraîner des troubles respiratoires ou intestinaux alors que d'autres peuvent être responsables de l'infection d'une blessure.
Les infections bactériennes peuvent être traitées grâce aux antibiotiques, qui le plus souvent inhibent une de leurs fonctions vitales (par exemple,
la pénicilline bloque la synthèse de la paroi cellulaire Les bactéries peuvent être très utiles à l'Homme lors des processus de traitement des eaux usées, dans l'agroalimentaire lors de la fabrication des yaourts ou du fromage et dans la production industrielle de nombreux composés chimiques 10
Sommaire 1 Histoire 2 Structure cellulaire 2. 1 Intracellulaire 2. 2 Extracellulaire 2. 3 Endospores 3 Croissance et reproduction 3. 1 La division cellulaire
3. 2 Croissance et culture des bactéries 3. 3 Paramètres influant sur la croissance microbienne 4 Génétique 4. 1 Matériel génétique 4. 2 Variation génétique
5 Morphologie et association des bactéries 6 Mobilité des bactéries 7 Métabolisme 8 Bactéries et écosystème 8. 1 Écosystème aquatique 8. 2 Bactérie du sol
8. 3 Environnements extrêmes 9 Interactions avec d'autres organismes 9. 1 Mutualistes 9. 2 Pathogènes 9. 3 pour l'Homme 9. 4 pour les plantes 10
Importance des bactéries dans l'industrie et les technologies 11 Classification et Identification 11.1 Classification phénotypique 11.2 Chimiotaxonomie 11.3 Classification moléculaire 11 4 Identification des
espèces bactériennes 12 Anecdotes 12.1 Les plus anciennes bactéries en vie 12.2 Recherche de bactéries extraterrestres 13 Références 14 Voir aussi 14.1 Articles connexes 14.2 Bibliographie
14.3 Liens externes modifier Histoire Les bactéries étant microscopiques, elles ne sont donc visibles qu'avec un microscope.
Antoine Van leeuwenhoek fut le premier à observer des bactéries, grâce à un microscope de sa fabrication, en 1668 11.
Il les appela animalcules et publia ses observations dans une série de lettres qu'il envoya à la Royal society 12,13, 14
Le mot bactérie apparaît pour la première fois avec le microbiologiste allemand Christian Gottfried Ehrenberg en 1828 15.
Ce mot dérive du grec ßa? t???, qui signifie bâtonnet Au XIX e siècle, les travaux de Louis pasteur ont révolutionné la bactériologie.
Il démontra en 1859 que les processus de fermentation sont causés par des micro-organismes et que cette croissance n'était due pas à la génération spontanée.
Il démontra aussi le rôle des micro-organismes comme agents infectieux 16. Pasteur conçut également des milieux de culture, des procédés de destruction des micro-organismes comme l'autoclave et la pasteurisation
Le médecin allemand Robert Koch et ses collaborateurs mirent au point les techniques de culture des bactéries sur milieu solide.
Robert Koch est un des pionniers de la microbiologie médicale, il a travaillé sur le choléra, la maladie du charbon (anthrax) et la tuberculose.
Il démontra de façon claire qu'une bactérie pouvait être l'agent responsable d'une maladie infectieuse
et il proposa une série de postulats (les postulats de Koch, toujours utilisés aujourd'hui 17) confirmant le rôle étiologique d'un micro-organisme dans une maladie.
Il obtint le Prix nobel de médecine et de physiologie en 1905 18 Bien qu'on savait au dix-neuvième siècle que les bactéries sont la cause de nombreuses maladies,
il n'y avait pas d'antiseptique disponibles 19. En 1910, Paul Ehrlich développa le premier antibiotique, par l'évolution des colorants sélectifs teintés Treponema pallidum#le spirochaete
qui cause la syphilis#en composés qui tuent l'agent pathogène de façon sélective 20.
Ehrlich a reçu en 1908 le Prix nobel pour ces travaux sur l'immunologie, et pionnier de l'usage de colorant pour détecter
et identifier les bactéries, son travail étant la base de la coloration de Gram et de la coloration de Ziehl-Neelsen 21
Les microbiologistes Martinus Beijerinck et Sergei Winogradsky initièrent les premiers travaux de microbiologie de l'environnement et d'écologie microbienne
en étudiant les communautés microbiennes du sol et de l'eau et les relations entre ces micro-organismes
Si les bactéries étaient connues au XIX e siècle, il n'existait pas encore de traitement antibactérien.
En 1909, Paul Ehrlich mit au point un traitement contre la syphilis avant l'utilisation de la pénicilline en thérapeutique suggérée par Ernest Duchesne en 1897 et étudiée par Alexander Fleming en 1929
les Bacteria et les Archaea 22 modifier Structure cellulaire Schéma de la structure cellulaire d'une cellule bactérienne typique
En tant que procaryote (organisme sans noyau), les bactéries sont des cellules relativement simples, caractérisées par une absence de noyau et d'organites comme les mitochondries et les chloroplastes,
elles n'ont pas non plus de réticulum endoplasmique ou d'appareil de golgi 23 Une caractéristique importante des bactéries est la paroi cellulaire.
Les bactéries peuvent être divisées en deux groupes (Gram négatif et Gram positif) basé sur la différence de la structure et de la composition chimique de la paroi cellulaire mise en évidence grâce à la coloration de Gram.
Les bactéries à coloration de Gram positif possèdent une paroi cellulaire contenant un peptidoglycane (ou muréine) épais et des acides teichoïques alors que bactéries à coloration de Gram négatif présentent un peptidoglycane fin localisé dans le périplasme entre la membrane cytoplasmique et une membrane cellulaire externe.
La paroi donne à la bactérie sa forme et la protège contre l'éclatement sous l'effet de la très forte pression osmotique du cytoplasme.
Le peptidoglycane assure la rigidité de la paroi. Il existe toutefois des bactéries sans paroi:
ce sont les mycoplasmes modifier Intracellulaire Les bactéries étaient vues comme de simples sacs de cytoplasme,
mais de nombreux niveaux de complexité structurelle ont été découverts depuis, comme la découverte du cytosquelette procaryote 24,25,
et la localisation spécifique de protéines dans le cytoplasme bactérien 26. Ces compartiments subcellulaires ont été nommés hyperstructure bactériennes (bacterial hyperstructures en anglais) 27
Les bactéries possèdent un chromosome sous forme de filament d'ADN, support de l'hérédité. Le chromosome bactérien est en général circulaire.
En plus de cet ADN génomique, les cellules bactériennes contiennent souvent des molécules d'ADN circulaire extrachromosomiques appelées plasmides.
Les cellules contiennent aussi de nombreux ribosomes permettant la synthèse protéique grâce au mécanisme de la traduction.
Le cytoplasme des procaryotes contient souvent des substances intracellulaires de réserve qui sont des stocks de nutriments sous forme de glycogène, amidon ou poly-b-hydroxybutyrate (PBH).
Certaines espèces de bactéries aquatiques possèdent des vésicules à gaz qui assurent la flottabilité des cellules.
D'autres espèces, les bactéries magnétotactiques, ont la particularité de présenter un magnétosome modifier Extracellulaire
Helicobacter pylori micrographie électronique montrant de nombreux flagelles à la surface de la cellule Beaucoup de bactéries possèdent des structures extra-cellulaires comme des flagelles utilisés pour la mobilité des cellules,
des fimbriae permettant l'attachement et des pili sexuels indispensables au phénomène de conjugaison. Les bactéries hétérotrophes peuvent utiliser leurs flagelles pour se diriger vers des zones riches en substances organiques (nutriments) grâce au phénomène appelé chimiotactisme
Quelques bactéries peuvent fabriquer de fines couches externes à la paroi cellulaire, généralement constituées de polysaccharides (des sucres).
Quand la couche est compacte, on parle de capsule. Les capsules constituent par exemple une barrière de protection de la cellule contre l'environnement externe
et aussi contre la phagocytose. Elle facilite aussi l'attachement aux surfaces et la formation de biofilms.
Klebsiella, Bacillus anthracis, Streptococcus pneumoniae sont des exemples de bactéries capsulées. Quand la couche est diffuse, on parle de couche mucoïde.
Quand la couche est plus épaisse, on parle de glycocalyx. Le glycocalyx permet aux bactéries d'adhérer à un support.
Certaines bactéries qualifiées de bactéries engainées produisent une couche externe dense et rigide: la gaine.
Ce phénomène est courant chez les bactéries de l'eau qui forment des chaînes filamenteuses (Sphaerotilus natans par exemple).
) La gaine protège les cellules contre les turbulences de l'eau. Les bactéries du groupe Cytophaga#Flavobacterium produisent une couche muqueuse
qui leur permet de rester en contact étroit avec un milieu solide. D'autres bactéries comme les Spirillum peuvent s'envelopper d'une couche protéique appelée la couche S
modifier Endospores Bacillus anthracis (colorés en violet) se développent dans un liquide céphalorachidien Quelques bactéries, Gram positif,
comme Bacillus, Clostridium, Sporohalobacter, Anaerobacter et Heliobacterium peuvent fabriquer des endospores leur permettant de résister à certaines conditions de stress environnemental ou chimique 28.
La formation d'un endospore n'est pas un processus de reproduction. Les Anaerobacter peuvent faire jusqu'à sept endospores en une seule cellule 29.
Les bactéries à endospores ont une zone centrale de cytoplasme contenant l'ADN et ribosomes entouré par une couche du cortex
et protégé par un manteau imperméable et rigide Les bactéries à endospores peuvent survivre dans des conditions physiques et chimiques extrêmes,
tels que des niveaux élevés de rayonnement UV, les rayons gamma, les détergents, les désinfectants, une forte chaleur ou pression et à la dessiccation 30.
Les endospores peuvent même permettre aux bactéries de survivre à l'exposition au vide et au rayonnement dans l'espace 33
Les bactéries à endospore peuvent également causer des maladies: par exemple, la maladie du charbon peut être contractée par l'inhalation d'endospores Bacillus anthracis,
et la contamination des plaies profondes avec la perforation par Clostridium tetani responsable du tétanos 34
modifier Croissance et reproduction modifier La division cellulaire Deux cellules identiques sont produites à partir d'une cellule mère.
La division bactérienne est précédée par la duplication du chromosome bactérien grâce à la réplication de l'ADN
Quelques bactéries présentent des structures reproductives plus complexes mais toujours de manière asexuée, facilitant la dispersion:
Myxococcus élabore des fructifications, tandis que Streptomyces forme des hyphes aériens Quand elles se trouvent dans un milieu propice les bactéries peuvent se multiplier à une allure vertigineuse.
Une population de bactéries peut doubler toutes les 20 minutes en fonction de: la disponibilité en nutriments, la présence de bactéries concurrentes, la présence de prédateurs (par exemple des paramécies), la présence de bactériophages, la présence d'antibiotiques (inhibant par exemple la synthèse de la paroi bactérienne, entraînant donc leur mort) produits par des champignons ou des actinomycètes
(bactéries filamenteuses modifier Croissance et culture des bactéries Colonies bactériennes sur milieu solide gélosé en boîte de Pétri
Dans la nature, depuis des milliards d'années, les biofilms et concrétions bactériennes contribuent au cycle de nombreux éléments, à la formation de filons riches en métaux (par bioconcentration),
ainsi qu'à la formation et dégradation des roches Au laboratoire, les bactéries peuvent être cultivées en milieu de culture liquide ou en milieu solide.
Le milieu de culture doit apporter les éléments nutritifs ou nutriments élémentaires à la bactérie.
Les milieux de culture gélosés solides sont utilisés pour isoler des cultures pures de cellules bactériennes.
Dans le cas des bactéries se divisant rapidement, une cellule bactérienne dispersée sur un milieu gélosé va se multiplier et, au bout de 24 à 48 heures, devenir un amas de bactéries, appelé une colonie bactérienne, visible à l'oeil nu
Le temps de génération est le temps nécessaire à une bactérie pour se diviser. Le temps de génération correspond donc au temps nécessaire pour qu'une population de cellules double en nombre.
Ce temps est très variable selon les espèces de bactéries et les conditions environnementales. Au laboratoire, dans des conditions idéales, il est par exemple de 20 minutes pour Escherichia coli, 100 minutes pour Lactobacillus acidophilus, 1 000 minutes pour Mycobacterium tuberculosis
La croissance d'une population bactérienne dans un milieu de culture liquide non renouvelé, peut être observée dans le temps.
Les cellules se divisent, et leur nombre augmente avec le temps . Si on relève le nombre de bactéries à différents intervalles au cours de la croissance,
on obtient une courbe de croissance. Elle présente quatre phases principales La phase de latence correspond à une période d'adaptation de la bactérie au milieu Au cours de la phase de croissance exponentielle,
les bactéries se développent de façon maximale avec un taux de croissance maximal et constant Après une phase transitoire de ralentissement,
le nombre de bactéries n'évolue plus: c'est la phase stationnaire. Les divisions bactériennes qui se font encore sont compensées par la mort de bactéries La dernière phase est la phase de mortalité ou de déclin.
Les bactéries ne se divisent plus, elles meurent et peuvent être lysées. Le milieu de culture n'apporte plus les conditions nécessaires au développement des bactéries.
On observe une courbe de décroissance exponentielle progressive. modifier Paramètres influant sur la croissance microbienne
Certaines conditions environnementales (paramètres physico-chimiques) influencent la croissance des micro-organismes. Parmi celles-ci figurent le ph (acidité et alcalinité), la température, la présence d'O 2, de CO 2,
la disponibilité de l'eau. La plupart des micro-organismes tolèrent une gamme de p H permettant la croissance.
Le ph optimal de croissance de beaucoup de bactéries est proche de la neutralité (ph 7). Les micro-organismes acidophiles se développent à des ph acides,
alors que les micro-organismes alcalinophiles se développent à des ph basiques. De même, les bactéries peuvent être distinguées selon leur aptitude à croître en fonction de la température.
Les mésophiles se développent généralement à des températures comprises entre 20 et 45°C. Les psychrophiles possèdent des températures optimales de croissance inférieures à 15°C,
alors que les bactéries thermophiles croissent de façon optimale à des températures comprises entre 45 et 70°C. Les micro-organismes ayant des températures optimales de croissance supérieures à 70°C sont qualifiés d'hyperthermophiles
modifier Génétique modifier Matériel génétique La plupart des bactéries possèdent un unique chromosome circulaire. Il existe toutefois de rares exemples de bactéries,
comme Rhodobacter sphaeroides possédant deux chromosomes. Les bactéries du genre Borrelia ont la particularité d'avoir un génome linéaire
et segmenté, ce qui est exceptionnel chez les procaryotes. La taille du génome peut être très variable selon les espèces de bactéries étudiées.
Le génome de la souche de Escherichia coli séquencé en 1997 est constitué de 4, 6 Mpb (4 600 000 paires de bases),
il code 4 200 protéines. Le génome d'une autre souche de E coli séquencé en 2001 comprend 5
5 Mpb codant 5 400 protéines. Certaines bactéries présentent un tout petit génome, comme la bactérie parasite Mycoplasma genitalium avec un génome de 580 000 paires de bases et la bactérie endosymbiotique d'insecte, Candidatus Carsonella ruddii avec un génome de seulement 160 000 paires de bases
35. Au contraire, la bactérie du sol Sorangium cellulosum possède un génome constitué de 12 200 000 paires de bases 36.
Chose peu commune, les Spirochètes ainsi que des Streptomyces présentent la particularité d'avoir un chromosome linéaire 37
Les bactéries contiennent également souvent un ou plusieurs plasmides, qui sont des molécules d'ADN extrachromosomique.
Ces plasmides peuvent conférer certains avantages aux bactéries, comme la résistance à des antibiotiques ou des facteurs de virulence.
Les plasmides sont généralement des ADN double brin circulaire. Ils se répliquent indépendamment du chromosome.
Le chromosome bactérien peut d'autre part intégrer de l'ADN de virus bactérien (bactériophage). Ces bactériophages peuvent contribuer au phénotype de l'hôte 38.
Par exemple, les bactéries Clostridium botulinum et Escherichia coli o157: H7 synthétisent une toxine codée par un gène qui provient d'un phage
qui s'est intégré au génome de ces bactéries au cours de l'évolution 39 modifier Variation génétique
Les bactéries sont des organismes asexués, après la division bactérienne, les cellules filles héritent d'une copie identique du génome de leur parent.
Cependant, toutes les bactéries sont capables d'évoluer par modification de leur matériel génétique causé par des recombinaisons génétiques ou des mutations.
Les mutations (changements plus ou moins ponctuels et aléatoires de l'information génétique d'une cellule) proviennent d'erreur durant la réplication de l'ADN
ou de l'exposition à des agents mutagènes. le taux de mutation varie grandement selon les espèces ou les souches bactériennes 40
Quelques bactéries peuvent également transférer du matériel génétique entre les cellules. Il existe 3 mécanismes de transfert de gènes entre les cellules:
la transformation, la transduction, et la conjugaison. Au cours de la transformation, c'est un plasmide qui est transféré dans la cellule bactérienne,
alors qu'au cours de la transduction, le transfert d'ADN a lieu par l'intermédiaire d'un bactériophage.
Au cours de la conjugaison, deux bactéries peuvent se rapprocher, grâce à des structures spéciales, les pili, et il y a alors un transfert d'ADN d'une bactérie à une autre.
L'ADN étranger peut être intégré dans le génome et être transmis aux générations suivantes. Cette acquisition de gènes, provenant d'une bactérie ou de l'environnement
est appelé transfert horizontal de gènes (HGT pour horizontal gene transfer) 41. Le transfert de gènes est particulièrement important dans les mécanismes de résistance aux antibiotiques 42
modifier Morphologie et association des bactéries Les bactéries présentent une grande diversité de morphologies et d'arrangements cellulaires
Les bactéries présentent une grande diversité de tailles et de formes. Les cellules bactériennes typiques ont comprise une taille entre 0, 5 et 5 m de longueur,
cependant, quelques espèces comme Thiomargarita namibiensis et Epulopiscium fishelsoni peuvent mesurer jusqu'à 500 m (0,
5 mm) de long et être visibles à l'oeil nu 43. Parmi les plus petites bactéries, les Mycoplasmes mesurent 0, 3 m,
soit une taille comparable à certains gros virus 44 La plupart des bactéries sont appelées soit sphériques
coques (pl. cocci, du grecque kókkos, grain), ou soit en forme de bâtonnets, appelés bacilles (pl. baccili, du Latin baculus, bâton).
Il existe aussi des formes intermédiaires: les coccobacilles. Quelques bactéries en forme de bâtonnets sont légèrement incurvées comme les Vibrio.
D'autres bactéries sont hélicoïdales. Ce sont des spirilles si la forme est invariable et rigide,
des spirochètes si l'organisme est flexible et peut changer de forme. La grande diversité de formes est déterminée par la paroi cellulaire et le cytosquelette.
Les différentes formes de bactéries peuvent influencer leur capacité d'acquérir des nutriments, de s'attacher aux surfaces,
de nager dans un liquide et d'échapper à la prédation Escherichia coli observée au microscope électronique
Beaucoup d'espèces bactériennes peuvent être observées sous forme unicellulaire isolée alors que d'autres espèces sont associées en paires (diploïdes) comme les Neisseria ou en chaînette, caractéristique des Streptocoques.
Dans ces cas, les coques se divisent selon un axe unique et les cellules restent liées après la division.
Certains coques se divisent selon un axe perpendiculaire et s'agencent de façon régulière pour former des feuillets.
D'autres se divisent de façon désordonnée et forment des amas comme les membres du genre Staphylococcus
qui présentent un regroupement caractéristique en grappe de raisins. D'autres bactéries peuvent s'élonger
et former des filaments composés de plusieurs cellules comme les Actinomycetes. D'autres organismes comme les cyanobactéries forment des chaînes appelées trichomes.
Dans ce cas, les cellules sont en relation étroite et les échanges physiologiques sont favorisés Gamme de tailles montrant les cellules procaryotes en relation avec d'autres organismes et biomolécules
En dépit de leur apparente simplicité, les bactéries peuvent aussi former des associations complexes. Elles peuvent s'attacher aux surfaces
et former des agrégations appelées biofilms. Les bactéries présentes dans le biofilm peuvent présenter un arrangement complexe de cellules
et de composants extra-cellulaires, formant des structures secondaires comme des microcolonies, dans lesquelles se forme un réseau de canal facilitant la diffusion des nutriments
Au sein des biofilms des relations s'établissent entre bactéries, conduisant à une réponse cellulaire intégrée. Les molécules de la communication cellulaire ou lang sont soit des Homosérine lactones pour les bactéries à Gram négatif,
soit des peptides courts pour les bactéries à Gram positif. De plus au sein de biofilms établis, les caractéristiques physico-chimiques (ph, oxygénation, métabolites) sont néfastes au bon développement bactérien
et constituent des conditions stressantes. Les bactéries mettent en place des réponses de stress qui sont autant d'adaptation à ces conditions défavorables.
En général les réponses de stress rendent les bactéries plus résistantes à toute forme de destruction par des agents mécaniques ou des molécules biocides
modifier Mobilité des bactéries Flagelle d'une bactérie Gram. -La base entraine une rotation du crochet et des filaments
Certaines bactéries sont mobiles et peuvent se déplacer grâce à un ou plusieurs flagelles, d'autres bactéries peuvent se déplacer par glissement
Les flagelles des bactéries sont de longs appendices protéiques flexibles. Leur nombre et leur position peuvent différer selon les espèces de bactéries.
La flagellation (ou ciliature) polaire monotriche correspond à la présence d'un seul flagelle à un pôle de la bactérie (exemple des Vibrio.
La flagellation polaire lophotriche correspond à la présence de plusieurs flagelles au pôle de la bactérie (Pseudomonas par exemple).
) D'autres bactéries comme Escherichia coli produisent des flagelles sur toute la surface cellulaire et possèdent donc une flagellation péritriche
Beaucoup de bactéries (comme Escherichia coli) ont deux modes distincts de circulation: mouvement vers l'avant (natation) et mouvement de rotation ou mouvement de roulis également et appelé lang en anglais.
Le tumbling leur permet de se réorienter et leur fait faire un mouvement en trois dimensions,
évoluant vers un mouvement de marche au hasard 45. Les flagelles d'un groupe de bactéries, les spirochaetes, se trouvent entre deux membranes dans l'espace périplasmique 46
Le filament du flagelle est constitué d'une protéine, la flagelline. Le type de rotation du flagelle peut déterminer le type de mouvement de la bactérie
Les bactéries mobiles peuvent réagir à des stimuli, être attirées par des substances nutritives comme les sucres, les acides aminés, l'oxygène,
ou être repoussées par des substances nuisibles. il s'agit de la chimiotaxie, phototaxis et magnetotaxis 47,48.
Ce comportement est appelé le chimiotactisme. Des chimiorécepteurs de nature protéique sont présents au niveau de la membrane plasmique
et du périplasme des bactéries et peuvent détecter différentes substances attractives ou nocives Les ions de cuivre bloquent la rotation des flagelles.
Pour le faire repartir, on recourt à l'acide éthylènediaminetétraacétique, capable de capturer les ions
et donc d'en libérer le flagelle modifier Métabolisme Une cyanobactérie: Anabaena sperica Le métabolisme d'une cellule est l'ensemble des réactions chimiques
qui se produisent au niveau de cette cellule. Pour réaliser ce processus, les bactéries, comme toutes les autres cellules, ont besoin d'énergie.
L'ATP est la source d'énergie biochimique universelle. L'ATP est commune à toutes les formes de vies,
mais les réactions d'oxydoréduction impliquées dans sa synthèse sont variées très selon les organismes et notamment chez les bactéries.
Les bactéries vivent dans pratiquement toutes les niches environnementales de la biosphère. Elles peuvent ainsi utiliser une très large variété de source de carbone et/ou d'énergie.
Les bactéries peuvent être classées selon leur type de métabolisme en fonction des sources de carbone et d'énergie utilisés pour la croissance, les donneurs d'électrons et les accepteurs d'électrons.
L'énergie cellulaire des chimiotrophes est d'origine chimique alors que celle des phototrophes est d'origine lumineuse.
La source de carbone des autotrophes est le CO 2, tandis que des substrats organiques sont la source de carbone des hétérotrophes.
Il est aussi possible de distinguer deux sources possibles de protons (H+)et d'électrons (e:
-les bactéries réduisant des composés minéraux sont des lithotrophes alors que celles réduisant des substances organiques sont des organotrophes
Les bactéries peuvent être divisées en quatre grands types nutritionnels en fonction de leurs sources de carbone et d'énergie
Les photoautotrophes utilisent la lumière comme source d'énergie et le CO 2 comme source de carbone. Les photohétérotrophes se développent par photosynthèse.
Ils assimilent le CO 2 en présence d'un donneur d'électrons. Les chimioautotrophes utilisent des substrats inorganiques réduits pour l'assimilation réductrice du CO 2 et comme source d'énergie.
Les chimiohétérotrophes utilisent des substrats organiques comme source de carbone et d'énergie. Chez les chimiohétérotrophes, les substrats sont dégradés en plus petites molécules pour donner des métabolites intermédiaires (pyruvate, acétylcoa)
#qui sont dégradés eux-mêmes avec production de CO 2, H 2 O et d'énergie. Ces réactions productrices d'énergie sont des réactions d'oxydation d'un substrat hydrogéné
avec libération de protons et d'électrons grâce à des déshydrogénases. Le transfert de protons et d'électrons à un accepteur final est réalisé par toute une série d'enzymes
qui forment une chaîne de transport électronique. L'énergie ainsi produite est libérée par petites étapes
dans le but d'être transférée dans des liaisons chimiques riches en énergie (ATP, NADH, NADPH). Suivant la nature de l'accepteur final d'électrons, on distingue les processus de la respiration et de la fermentation.
La respiration peut être aérobie quand O 2 est l'accepteur final de protons et d'électrons,
ou anaérobie (respiration nitrate, et respiration fumarate par exemple). ) Dans tous les cas, l'accepteur final d'électrons doit être oxydée une molécule (O 2, NO 3#,SO 2#).Chez les organismes aérobies,
l'oxygène est utilisé comme accepteur d'électrons. Chez les organismes anaérobies, d'autres composés inorganiques comme le nitrate,
le sulfate ou le dioxyde de carbone sont utilisés comme accepteurs d'électrons. Ces organismes participent à des processus écologiques très importants lors de la dénitrification
la réduction des sulfates et l'acétogénèse. Ces processus sont aussi importants lors de réponses biologiques à la pollution, par exemple,
les bactéries réduisant les sulfates sont responsables de la production de composés hautement toxiques à partir du mercure (méthyl et diméthylmercure) présent dans l'environnement.
Les anaérobies (non respiratoires) utilisent la fermentation pour fournir de l'énergie à la croissance des bactéries.
Au cours de la fermentation, un composé organique (le substrat ou la source d'énergie) est le donneur d'électrons
tandis qu'un autre composé organique est l'accepteur d'électrons. Les principaux substrats utilisés lors de la fermentation sont des glucides
des acides aminés, des purines et des pyrimidines. Divers composés peuvent être relargués par les bactéries lors des fermentations.
Par exemple, la fermentation alcoolique conduit à la formation d'éthanol et de CO 2. Les bactéries anaérobies facultatives sont capables de modifier leur métabolisme entre la fermentation et différents accepteurs terminaux d'électrons,
selon les conditions du milieu où elles se trouvent Selon leur mode de vie, les bactéries peuvent être classées en différents groupes
Les aérobies strictes peuvent vivre uniquement en présence de dioxygène ou oxygène moléculaire (O 2). Les aéro-anaérobies facultatives peuvent vivre en présence ou en absence de dioxygène.
Les anaérobies ne peuvent vivre qu'en absence de dioxygène. Les aérotolérants sont des organismes anaérobies
Les bactéries lithotrophes peuvent utiliser des composés inorganiques comme source d'énergie. L'hydrogène, le monoxyde de carbone, l'ammoniac (NH 3), les ions ferreux ainsi que d'autres ions métalliques réduits et quelques composés du soufre réduit.
En plus de la fixation du CO 2 lors de la photosynthèse, quelques bactéries peuvent fixer l'azote N 2 (fixation de l'azote
Des bactéries aérobies, anaérobies et photosynthétiques sont capables de fixer l'azote. Les cyanobactéries qui fixent l'azote,
possèdent des cellules spécialisées (les hétérocystes modifier Bactéries et écosystème Les bactéries, avec les autres micro-organismes participent pour une très large part à l'équilibre biologique existant à la surface de la Terre.
Ils colonisent en effet tous les écosystèmes et sont à l'origine de transformations chimiques fondamentales lors des processus biogéochimiques responsables du cycle des éléments sur la planète
modifier Écosystème aquatique Les eaux naturelles comme les eaux marines (océans) ou les eaux douces (lacs, mares, étangs, rivières#)sont des habitats microbiens très importants.
Les matières organiques en solution et les minéraux dissous permettent le développement des bactéries. Les bactéries participent dans ces milieux à l'autoépuration des eaux.
Elles sont aussi la proie des protozoaires. Les bactéries composant le plancton des milieux aquatiques sont appelées le bactérioplancton
modifier Bactérie du sol Le sol est composé de matière minérale provenant de l'érosion des roches
et de matière organique (l'humus) provenant de la décomposition partielle des végétaux. La flore microbienne y est variée très.
Elle comprend des bactéries, des champignons, des protozoaires, des algues, des virus, mais les bactéries sont les représentants les plus importants quantitativement.
On peut y retrouver tous les types de bactéries, des autotrophes, des hétérotrophes, des aérobies, des anaérobies, des mésophiles, des psychrophiles, des thermophiles.
Tout comme les champignons, certaines bactéries sont capables de dégrader des substances insolubles d'origine végétale comme la cellulose
la lignine, de réduire les sulfates, d'oxyder le soufre, de fixer l'azote atmosphérique
et de produire des nitrates. Les bactéries jouent un rôle dans le cycle des nutriments des sols,
et sont notamment capables de fixer l'azote. Elles ont donc un rôle dans la fertilité des sols pour l'agriculture.
Les bactéries abondent au niveau des racines des végétaux avec lesquels elles vivent en mutualisme Une cheminée hydrothermale
À la différence des milieux aquatiques, l'eau n'est pas toujours disponible dans les sols.
Les bactéries ont mis en place des stratégies pour s'adapter aux périodes sèches. Les Azotobacter produisent des cystes, les Clostridium et les Bacillus des endospores ou d'autres types de spores chez les Actinomycètes
modifier Environnements extrêmes Les bactéries peuvent aussi être rencontrées dans des environnements plus extrêmes. Elles sont qualifiées d'extrémophiles.
Des bactéries halophiles sont rencontrées dans des lacs salés, des bactéries psychrophiles sont isolées d'environnements froids comme des océans Arctique et Antarctique, des banquises.
Des bactéries thermophiles sont isolées des sources chaudes ou des cheminées hydrothermales modifier Interactions avec d'autres organismes
En dépit de leur apparente simplicité, les bactéries peuvent entretenir des associations complexes avec d'autres organismes.
Ces associations peuvent être répertoriées en parasitisme, mutualisme et commensalisme. En raison de leurs petites tailles, les bactéries commensales sont ubiquitaires
et sont rencontrées à la surface et à l'intérieur des plantes et des animaux modifier Mutualistes Dans le sol, les bactéries de la rhizosphère (couche de sol fixée aux racines des plantes) fixent l'azote
et produisent des composés azotés utilisés par les plantes (exemple de la bactérie Azotobacter ou Frankia).
En échange, la plante excrète au niveau des racines des sucres, des acides aminés et des vitamines qui stimulent la croissance des bactéries.
D'autres bactéries comme Rhizobium sont associées aux plantes légumineuses au niveau de nodosités sur les racines Il existe de nombreuses relations symbiotiques ou mutualistes de bactéries avec des invertébrés.
Par exemple, les animaux qui se développent à proximité des cheminées hydrothermales des fonds océaniques comme les vers tubicoles Riftia pachyptila,
les moules Bathymodiolus ou la crevette Rimicaris exoculata vivent en symbiose avec des bactéries chimiolitho-autotrophes.
Buchnera est une bactérie endosymbiote des aphides (puceron. Elle vit à l'intérieur des cellules de l'insecte
et lui fournit des acides aminés essentiels. La bactérie Wolbachia est hébergée dans les testicules ou les ovaires de certains insectes.
Cette bactérie peut contrôler les capacités de reproduction de son hôte. Des bactéries sont associées aux termites
et lui apportent des sources d'azote et de carbone Des bactéries colonisant la panse des herbivores permettent la digestion de la cellulose par ces animaux.
La présence de bactéries dans l'intestin de l'Homme contribue à la digestion des aliments
mais les bactéries fabriquent également des vitamines comme l'acide folique, la Vitamine k et la biotine 49.
Des bactéries colonisent le jabot d'un oiseau folivore (consommateur de feuilles), le Hoazin (Opisthocomus hoazin.
Ces bactéries permettent la digestion de la cellulose des feuilles, de la même manière que dans le rumen des ruminants
Des bactéries bioluminescentes comme Photobacterium sont associées souvent à des poissons ou des invertébrés marins. Ces bactéries sont hébérgées dans des organes spécifiques chez leurs hôtes
et émettent une luminescence grâce à une protéine particulière: la luciférase. Cette luminescence est utilisée par l'animal lors de divers comportements comme la reproduction, l'attraction de proies ou la dissuasion de prédateurs
modifier Pathogènes Culture de Mycobacterium tuberculosis modifier pour l'Homme Les bactéries pathogènes sont responsables de maladies humaines
et causent des infections. Les organismes infectieux peuvent être distingués en trois types: les pathogènes obligatoires, accidentels ou opportunistes.
Un pathogène obligatoire ne peut survivre en dehors de son hôte. Parmi les bactéries pathogènes obligatoires, Corynebacterium diphtheriae entraîne la diphtérie,
Treponema pallidum est l'agent de la syphilis, Mycobacterium tuberculosis provoque la tuberculose, Mycobacterium leprae la lèpre, Neisseria gonorrhoeae la gonorrhée.
Les Rickettsia à l'origine du typhus sont des bactéries parasites intracellulaires. Un pathogène accidentel présent dans la nature peut infecter l'Homme dans certaines conditions.
Par exemple, Clostridium tetani provoque le tétanos en pénétrant dans une plaie. Vibrio cholerae entraîne le choléra suite à la consommation d'une eau contaminée.
Un pathogène opportuniste infecte des individus affaiblis ou atteints par une autre maladie. Des bactéries comme Pseudomonas aeruginosa
des espèces de la flore normale, comme des Staphylococcus de la flore cutanée, peuvent devenir des pathogènes opportunistes dans certaines conditions.
On rencontre ce type d'infection surtout en milieu hospitalier La capacité d'une bactérie à provoquer une maladie est son pouvoir pathogène.
L'intensité du pouvoir pathogène est la virulence. L'aboutissement de la relation bactérie-hôte et l'évolution de la maladie dépendent du nombre de bactéries pathogènes présentes dans l'hôte, de la virulence de cette bactérie, des défenses de l'hôte et de son degré de résistance.
Pour déclencher une maladie, les bactéries infectieuses doivent d'abord pénétrer dans l'organisme et adhérer à un tissu.
Des facteurs d'adhésion permettent la fixation des bactéries à une cellule. Le pouvoir invasif est la capacité de la bactérie à se répandre
et à se multiplier dans les tissus de l'hôte. Les bactéries peuvent produire des substances lytiques lui permettant de se disséminer dans les tissus.
Certaines bactéries présentent aussi un pouvoir toxinogène qui est la capacité de produire des toxines, substances chimiques portant préjudice à l'hôte.
On peut distinguer les exotoxines libérées lors de la multiplication des bactéries et les endotoxines fixées dans la membrane des bactéries
Les bactéries pathogènes tentant d'envahir un hôte rencontrent toutefois de nombreux mécanismes de défense assurant à l'organisme une protection aux infections.
Une bonne alimentation et une hygiène de vie correcte constituent une première protection. La peau, les muqueuses forment une première ligne de défense contre la pénétration d'organismes pathogènes.
Les bactéries de la flore normale constituent aussi une barrière de protection. Lorsqu'un micro-organisme a pénétré ces premières lignes de défense,
il rencontre des cellules spécialisées qui se mobilisent contre l'envahissement: ce sont les phagocytes.
L'inflammation est une réaction défensive non spécifique. Un second système de défense très efficace est le système immunitaire spécifique,
capable de reconnaître des antigènes portés ou sécrétés par les bactéries, et d'élaborer des anticorps et des cellules immunitaires spécifiques de ces antigènes
modifier pour les plantes Les bactéries pathogènes pour les plantes sont connues du grand public pour leur responsabilité dans la dévastation de cultures agricoles.
En 2001, les vergers du midi de la France étaient victimes d'une vague d'infection par une bactérie du genre xanthomonas 50
En biotechnologie végétale, la bactérie du sol Agrobacterium tumefaciens est utilisée pour sa capacité à transmettre un fragment d'ADN à la plante cible lors de son cycle infectieux
modifier Importance des bactéries dans l'industrie et les technologies L'origine de la microbiologie industrielle date de l'époque préhistorique.
Les premières civilisations ont utilisé sans le savoir des micro-organismes pour produire des boissons alcoolisées, du pain et du fromage
Les bactéries comme Lactobacillus, Lactococcus ou Streptococcus, combinées aux levures et moisissures interviennent dans l'élaboration d'aliments fermentés comme les fromages, les yaourts, la bière, le vin, la sauce de soja, le vinaigre, la choucroute
Les bactéries acétiques (Acetobacter, Gluconobacter) peuvent produire de l'acide acétique à partir de l'éthanol. Elles sont rencontrées dans les jus alcoolisés
et sont utilisées dans la production du vinaigre. Elles sont exploitées également pour la production d'acide ascorbique (Vitamine c) à partir du sorbitol transformée en sorbose
La capacité des bactéries hétérotrophes à dégrader une large variété de composés organiques est exploitée dans des processus de traitement des déchets comme la bioremédiation ou le traitement des eaux usées.
Des bactéries sont utilisées également dans les fosses septiques pour en assurer l'épuration. Des bactéries, capables de dégrader des hydrocarbures du pétrole,
peuvent être utilisées lors du nettoyage d'une marée noire. Le processus de nettoyage de milieux pollués par des micro-organismes est la bioremédiation
Des bactéries peuvent être utilisées pour récupérer des métaux d'intérêts économiques à partir de minerais. C'est la biolixiviation.
L'activité de bactéries est exploitée ainsi pour la récupération du cuivre Des bactéries peuvent être utilisées à la place de pesticides en lutte biologique pour combattre des parasites des plantes.
Par exemple, Bacillus thuringiensis produit une protéine Bt qui est toxique pour certains insectes. Cette toxine est utilisée en agriculture pour combattre des insectes
qui se nourrissent de plantes En raison de leur capacité à se multiplier rapidement et de leur relative facilité à être manipulées,
certaines bactéries comme Escherichia coli sont des outils très utilisés en biologie moléculaire, génétique et biochimie.
Les scientifiques peuvent déterminer la fonction de gènes, d'enzymes ou identifier des voies métaboliques nécessaires à la compréhension fondamentale du vivant
et permettant également de mettre en oeuvre de nouvelles applications en biotechnologie De nombreuses enzymes utilisées dans divers processus industriels ont été isolées de micro-organismes.
Les enzymes des détergents sont des protéases de certaines souches de Bacillus. Des amylases capables d'hydrolyser l'amidon sont utilisées très dans l'industrie alimentaire.
La Taq polymérase utilisée dans les réactions de polymérisation en chaîne (PCR) pour l'amplification de l'ADN provient d'une bactérie thermophile Thermus aquaticus
Les bactéries génétiquement modifiées sont utilisées très pour la production de produits pharmaceutiques. C'est le cas par exemple de l'insuline, l'hormone de croissance, certains vaccins,
des interférons#Certaines bactéries comme Streptomyces sont employées très pour la production d'antibiotiques Certaines bactéries peuvent provoquer une dégradation d'installation (biocorrosion), en particulier les bactéries sulfatoréductrices
modifier Classification et Identification La taxonomie permet de classer de façon rationnelle les organismes vivants.
Chez les bactéries, les taxons dans l'ordre hiérarchique sont les suivant: phylums (ou divisions), classes, sous-classes, ordres, sous-ordres, familles, sous-familles, tribus, sous-tribus, genres, sous-genres, espèces et sous-espèces.
Différentes approches permettent la classification des bactéries Arbre phylogénétique montrant la diversité des bactéries, comparés aux autres organismes 51.
Les eucaryotes sont colorés en rouges, les archaea en vert et les bactéries en bleu modifier Classification phénotypique
Critères morphologiques (forme et groupement des bactéries, présence ou absence de flagelle, nature de la paroi, type de mobilité, présence d'endospore.
Critères physiologiques (type métabolique, source d'énergie, de carbone, d'azote, type de substrat utilisé, capacité à produire certaines molécules, produits de fermentation, métabolites secondaires#).
#Critères de pathogénicité. Critères de sérogroupage. modifier Chimiotaxonomie Il s'agit de l'analyse chimique de constituants cellulaires (structure et composition de la paroi, des membranes plasmiques, du peptidoglycane
modifier Classification moléculaire Composition en bases de l'ADN. Le pourcentage de guanine+cytosine varie d'un organisme à un autre,
mais est relativement constant au sein d'une même espèce. Le pourcentage de G+C varie de 25 à 70%chez les procaryotes.
Hybridation ADN#ADN. Cette technique permet de comparer la totalité du génome bactérien et d'estimer le degré d'homologie entre deux bactéries.
Cette caractéristique est importante dans la définition d'une espèce bactérienne. Séquençage des ARN ribosomiques ou séquençage des gènes codant les ARNR.
Chez les procaryotes, la comparaison de la séquence en nucléotides de l'ARN 16s permet d'évaluer le degré de parenté entre ces organismes.
Ces gènes sont qualifiés d'horloge moléculaire et permettent la classification phylogénétique. modifier Identification des espèces bactériennes
La détermination génétique des espèces se base sur l'étude des gènes des ARN ribosomiques.
Le choix des gènes des ARNR 16s se justifie pour les raisons suivantes les ARNR 16s sont des molécules ubiquistes;
leur structure est conservée bien car toute modification pourrait nuire à la synthèse protéique. Il en résulte une évolution très lente de ces gènes.
Le choix des gènes des ARNR plutôt que les ARNR eux-mêmes se base sur le choix de la technique de l'amplification par PCR.
Cette technique permet, à partir d'une colonie de bactéries, d'obtenir des fragments d'ADN correspondants au gène ou à une partie du gène.
Les analyses génétiques concernent également la région intergénique 16s-23s des opérons des ARN ribosomiques.
Cette dernière est une région de longueur variable selon les organismes. Elle donne une indication immédiate sur le fait
que deux souches données appartiennent ou non à la même espèce Tous les micro-organismes possèdent au moins une copie des gènes codant les ARN ribosomiques.
Ces molécules sont indispensables à la synthèse des protéines, raison pour laquelle cette séquence d'ADN est conservée très au sein des espèces (plus de 99%).
%Cette conservation de séquence permet d'utiliser cette région pour la détermination des espèces. En effet, Le degré de similarité des séquences d'ARNR entre deux organismes indique leur parenté relative.
La procédure utilisant l'ARNR 16s comme facteur d'identification implique l'extraction de l'ADN des bactéries d'une colonie.
Puis des amorces reconnaissant des zones très conservées du gène permettent d'amplifier par PCR une grande partie du gène ARNR 16s,
qui par la suite est séquencé. Les données sur la séquence nucléotidique sont comparées avec des bases de données de séquences déjà connues.
Les séquences du gène codant l'ARNR 16s sont connues pour plus de 4 000 souches bactériennes.
Ces séquences peuvent être consultées par interrogation de banques de données telles qu'EMBL et Genbank par les logiciels Fasta et Blast.
Le Ribosomal Data Project II (RDP) est également intéressant dans la mesure où sa base de données est spécifique de l'ARN 16s.
Ces logiciels sont accessibles en ligne sur l'internet. Selon les différents auteurs, le degré d'homologie entre deux bactéries pour qu'elles appartiennent à la même espèce doit être supérieur à 97%,voire 99
%Comme les gènes de la région intergénique 16s-23s sont conservés moins, ils diffèrent d'une souche à l'autre aussi bien au niveau de la séquence que de la longueur.
Ceci résulte de ce que de nombreuses bactéries ont des copies multiples par génome de l'opéron de l'ARNR,
il en résulte lors de l'amplification un motif caractéristique. Comme pour le gène de l'ARNR 16s, l'étude systématique de la région intergénique 16s-23s requiert l'amplification de cette région par PCR.
modifier Les plus anciennes bactéries en vie Le 4 septembre 2007, un forage dans le pergélisol du nord-ouest Canadien a permis à des scientifiques de l'université de Californie dirigée par le professeur Eske Willerslev (Université de Copenhague) de mettre au jour une bactérie vieille d'environ 500 000
ans et toujours vivante On a retrouvé une bactérie endormie à l intérieur d'une abeille qui était dans de l'ambre (résine fossile-provenant de conifères de l'époque oligocène,
qui poussaient sur l'emplacement de l'actuelle Mer baltique-se présentant sous forme de morceaux durs et cassants, plus ou moins transparents, jaunes ou rougeâtres) depuis 25 à 40 millions d'années
De même, une bactérie demeurée endormie depuis 250 millions d'années a été découverte dans un cristal de sel.
Elle a été découverte par Russell Vreeland de l'université de West Chester en Pennsylvanie dans un lit de sel à environ 600 mètres sous terre, près de Carlsbad au Nouveau mexique
Dans l'espace, les bactéries deviendraient presque trois fois plus virulentes. C'est du moins le cas de Salmonella typhimurim, une bactérie responsable d'intoxication alimentaire.
Celles-ci ont fait un voyage à bord de la navette Atlantis en 2006. À leur retour, les bactéries qui avaient été conservées dans un récipient étanche,
ont été transmise à des souris. Il n'a fallu que le tiers de la dose habituelle pour tuer la moitié du groupe de souris
qui avait été infecté 52,53 modifier Recherche de bactéries extraterrestres On cherche actuellement à savoir s'il a existé une vie bactérienne sur la Planète mars. Certains éléments d'analyse du sol martien semblent s'orienter en ce sens,
et la présence abondante d'eau sur Mars jadis a pu peut-être constituer un terrain extrêmement favorable au développement de la vie bactérienne,
si elle est apparue. Si la chose venait à être confirmée, ce serait un élément important en faveur de l'hypothèse de panspermie
D'autres recherches s'intéressent aussi aux glaces de la lune jovienne Europe qui abritent de l'eau liquide sous leur surface
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Isolation of novel ultramicrobacteria classified as actinobacteria from five freshwater habitats in Europe and Asia.
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2006, p. 1283#7 lien PMID, lien DOI#(en) Lethal Bacteria Turn Deadlier After Space Travel#Des bactéries plus virulentes après un séjour dans l'espace, MICROBIOLOGIE
ultramicrobactérie Structure bactérienne Archaea Écologie microbienne Biofilm Liste de bactéries importantes sur le plan clinique Duplication génique chez les bactéries Symbiose Microbiote Interactions durables Hygiène Fomite
Bacteria (en) Référence Catalogue of Life: Bacteria (en) Référence Algaebase: genre Bacteria Shadbolt 1854 (en) Référence World Register of Marine Species:
taxon Bacteria (en)(+liste espèces) Référence NCBI: Bacteria (en) Morphologie et structure des bactéries (J. P. Euzéby) Voir un schéma détaillé d'une cellule bactérienne (de) Bacterial Growth and Cell Wall
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